Проходить через что-либо, о жидкости, газе и т.п., просачиваясь или проникая. Вода начала протекать через крышу после сильного дождя.
О времени, событиях и т.п.: проходить, миновать. Время протекало незаметно за чтением интересной книги.
О процессе, явлении и т.п.: происходить, развиваться в определённом порядке. Эксперимент должен протекать в контролируемых условиях.